Biopolttoaineilla tarkoitetaan kiinteitä, nestemäisiä ja kaasumaisia polttoaineita, joilla voi tuottaa lämpöä, sähköä tai käyttää koneiden ja ajoneuvojen polttoaineena. Biopolttoaineita saadaan metsästä, pelloilta sekä eri metsäteollisuuden ja elintarviketeollisuuden jalostusprosessien sivutuotevirtojen kautta. Bioperäisten jätteiden poltossa tai jätteiden ja jäteveden käsittelyn yhteydessä voidaan myös tuottaa lämpöä, sähköä tai biokaasua tai nestemäisiä polttoaineita.
Pohjoismaissa ja Baltian maissa, joissa pinta-ala suhteessa väestön määrään on suuri, biopolttoaineiden merkitys uusiutuvien energiamuotojen lisäämisessä on suuri. Nestemäisten ja kaasumaisten biopolttoaineiden kaupallinen käyttö on vielä melko vähäistä.
Kiinteiden puupolttoaineiden käyttö